More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3248 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  85.43 
 
 		 214 aa  351  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  55.44 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  51.34 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  44.95 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  48.17 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  32.58 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  30.16 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  31.79 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.7 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>