More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23110 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 235 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  29.89 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  21.89 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.85 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  38.64 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  47.17 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 335 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  42.62 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 376 aa  52  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  27.04 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>