More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3299 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  28.79 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  21.33 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  27.5 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  34.72 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1050  transcriptional regulator  20.93 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  48.94 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  22.08 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  32.64 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  22.08 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  22.08 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.44 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.63 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>