More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3710 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 222 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  48.88 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  48.59 
 
 		 185 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  43.15 
 
 		 184 aa  99  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  67.31 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  31.89 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.73 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  36.08 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  36.08 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 180 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  48.15 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>