More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1914 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 239 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  97.07 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  92.17 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  84.79 
 
 		 235 aa  384  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  82.87 
 
 		 236 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 252 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 		 244 aa  318  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  66.35 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  67.77 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  67.3 
 
 		 241 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  39.02 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  36.32 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  33.94 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  31.4 
 
 		 204 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 204 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  35.12 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  33.54 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 204 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 204 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
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NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  39.6 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
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NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
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NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  39.66 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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