More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0140 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 176 aa  337  5.9999999999999996e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 255 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.14 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  27.53 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  52.08 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.57 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  44.23 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 222 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 232 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>