More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1590 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  57.95 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  49.64 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  43.23 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  45.33 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  34.68 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  40.24 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>