More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0106 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.89 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.89 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.19 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  37.21 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 326 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>