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for query gene Cphy_1864 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
192 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 
212 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
255 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
247 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
291 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
185 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  53.19 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
332 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  34.31 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
231 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  29.38 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
191 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  23.56 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
189 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 
230 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  46.81 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
194 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
199 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  48.94 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  25.77 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  35.38 
 
 
235 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  46.3 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.982351 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
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NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
251 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal 
 
 
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