More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2113 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  100 
 
 		 195 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  92.67 
 
 		 191 aa  350  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  66.84 
 
 		 193 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  67.91 
 
 		 188 aa  220  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  55.68 
 
 		 205 aa  204  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  32.39 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  32.6 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 600 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  28.48 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.7 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 215 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 311 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.59 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  30.95 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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