More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4896 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  62.84 
 
 		 231 aa  287  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  55.07 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  50.88 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  46.48 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1655  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.928806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  58.14 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  45.31 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.02 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  44.78 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.38 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>