More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1655 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1655  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.928806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 207 aa  324  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  69.76 
 
 		 205 aa  298  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  69.27 
 
 		 205 aa  298  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  41.18 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  34.25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  36.05 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  21.9 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>