More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2823 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  28.28 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  33.16 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  30.39 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.61 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 287 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  51.92 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  51.92 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 428 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  43.08 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.06 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 408 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  33.65 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1767  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  28.31 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  19.14 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  34.29 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>