More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1100 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  85.57 
 
 		 195 aa  338  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 		 195 aa  308  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  25.27 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  23.26 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.72 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 446 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 261 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  47.17 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 497 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>