More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2304 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  48.9 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  45.11 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
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NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
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NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  30.89 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  20.83 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
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NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
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NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
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NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
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NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  30.63 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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