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for query gene Bcen_5772 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  99.47 
 
 
188 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  92.55 
 
 
188 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  92.55 
 
 
188 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  91.49 
 
 
188 aa  357  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  90.43 
 
 
188 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  76.22 
 
 
188 aa  297  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  76.22 
 
 
188 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 
188 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
201 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
189 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 
193 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
193 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
192 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 
191 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  35.33 
 
 
195 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
194 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
192 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  31.61 
 
 
176 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
198 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  33.33 
 
 
189 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
185 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
179 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
188 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
195 aa  98.2  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
600 aa  94.4  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  33.33 
 
 
179 aa  94  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  34.71 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
190 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
216 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
197 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  32.12 
 
 
187 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  31.82 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
206 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.14 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
211 aa  58.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
212 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
199 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
212 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
212 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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