156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4594 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  396  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  60.21 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  56.84 
 
 		 200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  39.27 
 
 		 220 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  23.81 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  18.64 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  19.21 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 209 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.31 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  18.64 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  18.08 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>