More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5390 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  40.98 
 
 		 195 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  33.15 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 216 aa  94.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  31.43 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 165 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 198 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 600 aa  82.4  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  27.07 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  28.07 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  27.07 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
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NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  24.74 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
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NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
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