More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4004 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.65 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
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NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
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NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  27.67 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
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NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
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NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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