More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2546 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
213 aa  436  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  57.95 
 
 
211 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  53.17 
 
 
205 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  55.73 
 
 
201 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  55.73 
 
 
201 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  52.49 
 
 
246 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  59.57 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  20.74 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  25.97 
 
 
209 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
192 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
190 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 
177 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  23.98 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
311 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  27.33 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 
183 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
191 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  25.77 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 
219 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
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NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
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NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0181151 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  23.94 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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