More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0187 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 206 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  31.94 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  33.15 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  32.22 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  35.66 
 
 		 162 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  35.93 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  32.4 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 176 aa  95.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 311 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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