261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5102 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  24.62 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  29.89 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.81 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  26.29 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  25.97 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.38 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  25 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  26.53 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  21.98 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>