More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0803 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  87.18 
 
 
196 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 
215 aa  327  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  65.8 
 
 
193 aa  275  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  53.37 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  52.85 
 
 
193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  46.2 
 
 
219 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
212 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
186 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
212 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 
186 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
210 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 
214 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
211 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 
179 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 
204 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  41.58 
 
 
222 aa  160  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  43.65 
 
 
209 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 
213 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 
192 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 
209 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
220 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
214 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
210 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  41.27 
 
 
219 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
219 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 
227 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  44.83 
 
 
162 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 
196 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
202 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
221 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
202 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
206 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
190 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  34.43 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
198 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
198 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
198 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
190 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
176 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
222 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
209 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
193 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  34.2 
 
 
196 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
206 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
197 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
200 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  33.16 
 
 
196 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
199 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
199 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
199 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
206 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  32.58 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
194 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  32.97 
 
 
195 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  32.61 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 
199 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
198 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
199 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
199 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
199 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  30.94 
 
 
194 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 
199 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
199 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
199 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>