More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2231 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  67.88 
 
 		 197 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  65.46 
 
 		 194 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  65.1 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 200 aa  204  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  51.31 
 
 		 200 aa  194  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  47.45 
 
 		 199 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  50.78 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  49.74 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  50.52 
 
 		 196 aa  191  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  47.72 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 198 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  47.4 
 
 		 195 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  50.54 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 311 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  46.28 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  46.28 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  45.74 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 199 aa  150  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  38.17 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.72 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  40.72 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  32.2 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 214 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  31.49 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  33.73 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  33.88 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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