More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2518 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  62.24 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  42.13 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  49.44 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  46.56 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  45.41 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 179 aa  141  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  36.9 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  41.58 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  43.56 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  49.35 
 
 		 162 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  34.17 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 199 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 199 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 199 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 176 aa  91.7  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 206 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.61 
 
 		 171 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  31.61 
 
 		 171 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  28.43 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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