More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2645 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 195 aa  187  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 223 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 198 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.49 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 202 aa  87.8  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 186 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 220 aa  84.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.49 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
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NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
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NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.55 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  30 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
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NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
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NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
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