123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7134 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  55.98 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  42.6 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  26.35 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  31.88 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  29.05 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  23.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  44.23 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.83 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>