228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1146 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  67.78 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  63.98 
 
 		 186 aa  232  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  68.89 
 
 		 182 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  65.76 
 
 		 187 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  60.77 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  60.77 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  65.22 
 
 		 187 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  61.58 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  51.37 
 
 		 188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.26 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  30.68 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  23.03 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.56 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 252 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  41.38 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0247  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  29.19 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  44.26 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  33.86 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02090  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.395705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 286 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>