117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0891 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  426  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  426  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  99.06 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  36.04 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.21 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  37.33 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 309 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  25.32 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  29.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  29.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  29.67 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  29.67 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  29.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  24.58 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.96 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  29.55 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 200 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  26.2 
 
 		 201 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 226 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 203 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 186 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 218 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 222 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 210 aa  42  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 198 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>