220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1058 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1041  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  34.52 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  23.98 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  30.99 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  28.47 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  27.03 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  26.92 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  24 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 180 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 196 aa  45.1  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  22.39 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  23.16 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>