77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5889 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  34.69 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  30.41 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  30.41 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  30.41 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  30.36 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  27.63 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  27.91 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  26.63 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  26.97 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  29.77 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  33.77 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 268 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  34.85 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 201 aa  42  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>