85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1041 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1041  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  26 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  29.47 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  23.53 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  23.53 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  20.93 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  27.91 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  22.79 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  20.27 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  32.81 
 
 		 219 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 215 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 239 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  19.73 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  29.69 
 
 		 226 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 244 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>