260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1897 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  381  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  35.45 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  34.68 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  27.6 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31770  hypothetical protein  30.68 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 415 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  46.94 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  18.9 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  46.94 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>