159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4097 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  71.81 
 
 		 190 aa  277  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  70.62 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  67.72 
 
 		 195 aa  222  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  52.11 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  61.62 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  63.64 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  31.06 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  36.21 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 238 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  41.27 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  52 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 241 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 429 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  34.62 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  32.06 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  28.12 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  45.1 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 414 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  48.08 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  33.75 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  38.33 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  32.05 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0862  hypothetical protein  42.37 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal  0.0703318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  48.21 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  33.07 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>