121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2098 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  42.54 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  43.46 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  40.84 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 240 aa  88.6  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  37.84 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31770  hypothetical protein  28.72 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3875  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2752  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  32.96 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 234 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 230 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  29.21 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  35.94 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  20.34 
 
 		 203 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 185 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 228 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>