35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2870 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 199 aa  268  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  68.72 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 200 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  63.87 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  54.74 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  44.85 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 247 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  36.67 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 178 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 208 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  36.67 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>