More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1972 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  52.13 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  30.46 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  38.6 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  44 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  40.98 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  39.02 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.08 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 388 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  47.92 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  44.68 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>