75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5337 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  74.37 
 
 		 200 aa  281  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  74.49 
 
 		 199 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  72.36 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 197 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 189 aa  204  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  39.7 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 141 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  36.67 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  36.76 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 428 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  38.71 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 270 aa  42  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 236 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 184 aa  42  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 201 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 245 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  25.41 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 240 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 244 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 241 aa  42  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  41.43 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>