More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5476 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
240 aa  473  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  63.88 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
236 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  49.4 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 
244 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 
207 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  41.52 
 
 
190 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  38.59 
 
 
201 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  43.17 
 
 
206 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
211 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
204 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  42.21 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 
195 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
192 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
184 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  34.36 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
196 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 
181 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
216 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
206 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
203 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
186 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
208 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 
191 aa  85.1  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  44.34 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.04 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  36.31 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.57 
 
 
196 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.46 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.21 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  35.05 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
205 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
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NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
198 aa  62  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  35.88 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0122195 
 
 
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NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 
208 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
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NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
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