257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1537 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 236 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  50.55 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 204 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 192 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 184 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 184 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 193 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 184 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 181 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  36.92 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  35.48 
 
 		 201 aa  89  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 186 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 200 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  38.98 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  46.23 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
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NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
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NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
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NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.23 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
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NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  32.18 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.41 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  32.67 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0122195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
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NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
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NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
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NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.82 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
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NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  29.59 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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