More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2633 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 
203 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
192 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
207 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
203 aa  111  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.75 
 
 
190 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
196 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
184 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
184 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
204 aa  104  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
184 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
196 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 
206 aa  101  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  41.18 
 
 
206 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 
206 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
222 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 
206 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 
195 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
240 aa  98.2  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.97 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
236 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
232 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
224 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 
244 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  45.19 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.79 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
239 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  36.46 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  28.25 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  28.49 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  29.89 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  29.01 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  27.01 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  28.48 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.94 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.943089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>