More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5135 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  75.27 
 
 		 193 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  67.76 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  67.76 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  68.31 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  50.3 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  48.92 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  40.22 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 212 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 240 aa  95.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 208 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 225 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.56 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  39.53 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  43.24 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  33.71 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  35.36 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.02 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  50.65 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  32.45 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2707  transcriptional regulator, TetR family  53.25 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  27.65 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.72 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>