235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2707 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2707  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  40.14 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  66.1 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  63.79 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 192 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  46.51 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  53.33 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  53.85 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  61.4 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1066  transcriptional regulator, TetR family  69.39 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.52451  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  52.56 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  57.38 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  51.61 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  46.84 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  57.89 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  54.39 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
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NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
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NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  50.88 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
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NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
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NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 400 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
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NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
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NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
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