More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3517 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  89.87 
 
 		 237 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  83.61 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  84.05 
 
 		 234 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  82.83 
 
 		 234 aa  357  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  82.4 
 
 		 235 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  78.81 
 
 		 239 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
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NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  53 
 
 		 205 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  53 
 
 		 205 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
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NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  53.23 
 
 		 205 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 203 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  45.32 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  43.4 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
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NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  42.92 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  40.83 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  38.67 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 186 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  36.27 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
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NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 184 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 184 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
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NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
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NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
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NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
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NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
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NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.03 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  36.26 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  32.8 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1066  transcriptional regulator, TetR family  64 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.52451  normal  0.686522 
 
 
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NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  34.82 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.24 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
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NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
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NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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