220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3274 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 218 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  44.24 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  46.12 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  47.24 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  45.93 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  41.15 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  35.68 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.78 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.28 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.84 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 199 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  31.41 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  29.78 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 400 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>