More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2591 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 245 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  23.16 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.87 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 400 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 255 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  39.02 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  26.19 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>