202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4723 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  76.78 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  75.23 
 
 		 214 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  75.23 
 
 		 214 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  76.33 
 
 		 214 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  72.25 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  68.52 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  68.87 
 
 		 219 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 222 aa  241  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  61.86 
 
 		 222 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  48.56 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  44.54 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  44.65 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  45.75 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  41.28 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  46.93 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 203 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 207 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.48 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  36.13 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  36.06 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.56 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.9 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  51.9 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29.57 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.33 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  29.84 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  29.24 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>