More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1696 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  47.7 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  48.52 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  40.34 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.29 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.97 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.05 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  33.16 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.72 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  31.35 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  39.39 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.93 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>