More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1561 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.01 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.07 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  31.21 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.13 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  32.89 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  27.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  29.14 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.19 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
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NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
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NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
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NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  21.91 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
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NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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