247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4105 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  66.07 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  55.83 
 
 		 222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  41.36 
 
 		 197 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  37.56 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  35.38 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  37.06 
 
 		 196 aa  91.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  27.71 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.88 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  24.71 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  30.3 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.28 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  27.61 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>